Исчезновение Харухи Судзумии

Праздничные каникулы подходят к концу, и Кён приглашает всех членов SOS-дан на традиционное новогоднее чаепитие. Однако по возвращении в школу Кёя и его друзей ждёт шокирующая реальность: их одноклассница Харухи Судзумия, источник всех сумасшедших приключений, бесследно исчезла. Более того, её никто не помнит, кроме них самих. Мир кардинально изменился: на месте литературного клуба теперь существует шахматный, Микуру Асахина не узнаёт Кёна, а Ицуки Койдзуми стал обычным студентом.

Кён быстро осознаёт, что попал в альтернативную реальность, где Харухи никогда не существовало, а значит, не было и её способности бессознательно изменять мир. Единственная зацепка — таинственная девочка по имени Нагато Юки, которая, в отличие от своей прежней инопланетной версии, теперь застенчива и эмоциональна. Именно она, как последний мостик между мирами, может знать, что произошло. Кён должен разгадать загадку этого нового мира и найти способ вернуть всё на свои места, пока реальность не рухнула окончательно.